保健部是全市妇幼保健技术指导中心和管理中心，也是上虞市产前筛查中心、新生儿疾病筛查中心、新生儿听力筛查中心、智力残疾康复技术指导中心。中心一直秉承“以保健为中心，保健与临床相结合，面向群体，面向基层与预防为主”的工作方针开展群体保健工作和保健技术服务。 　　保健部设有妇女保健科和儿童保健科。妇女保健科下设围产保健、妇女心理保健、孕妇营养咨询、婚（孕）前保健、青春期保健、更年期保健、产后康复以及优生咨询门诊等二级专科。儿童保健科下设儿童建册门诊、生长发育门诊、儿童营养性疾病门诊、儿童心理行为保健、高危儿门诊、新生儿疾病筛查、儿童眼保健、口腔保健、听力保健门诊，开展儿童智力测定、儿童常见病和多发病的防治、新生儿听力筛查（OAE和AABR筛查）、集居儿童保健、脐血流监测、24小时动态血压监测、胎心监护、孕期营养咨询等技术服务等。 　　保健部经过几代保健人的努力，保健部已与辖区的21个乡镇（街道）、村居委形成了较为稳固的三级妇幼保健网络，全市妇幼保健工作不断发展。全市本地孕产妇连续八年保持零死亡，婴儿死亡率和5岁以下儿童死亡率在绍兴地区中趋于较低水平。上虞市不但是绍兴地区唯一一家国家级妇幼卫生监测市，而且被授予“浙江省先进育儿健康示范基地”、“浙江省孕产妇健康教育学校”。多次接受国家级和省级妇幼卫生监测质控检查，并获得肯定和好评。产前筛查工作连续被评为绍兴地区一、二等奖。2009年、2011年被评为浙江省妇幼卫生先进集体。