眼科创建于1956年，是苏州大学眼科学硕士培养点，近十年来先后引进了德国MOLLER双人双目手术显微镜、美国爱尔康U-Ⅱ超声乳化仪、博士伦玻璃体切割仪、眼科专用A/B超、日本TOPCON全自动眼底照相机、美国IRIDEX半导体532眼底激光治疗仪、角膜曲率仪、非接触眼压计等一系列专科高档设备，为眼科临床提供了可靠保证。现常规开展白内障超声乳化、青光眼外引流、视网膜脱离修复、玻璃体切割、眼眶肿瘤摘除等各类手术，尤其是角膜移植、羊膜贴敷等技术达到省内先进水平，获新技术引进三等奖。常规开展眼底荧光造影、眼底激光技术，为眼底病、糖尿病性视网膜病变提供良好条件。《自动角膜刀板层角膜移植的临床研究》被立为市科研项目，并且已取得了较好的临床效果。 　　眼科坚持团队合作精神，每一位主治医师以上人员在全面掌握常见病、多发病的诊治基础上，专攻某一类疾病，科内各正、副主任医师在白内障、青光眼、斜视、弱视、屈光不正、糖尿病性视网膜病变、玻璃体切除、角膜移植等眼科专病方面均有独到的一技之长，从而提升了科室整体水平。 　　眼科2006年与法国佩提亚-萨勒佩提亚医院集团成立眼科医疗合作中心，2008年与德国卡尔斯鲁厄市市立医院成立眼科合作中心，同时科室与上海、北京、南京等地区眼病专家保持热线远程会诊，尽最大可能使每一位病人得到及时明确的诊断和治疗，为患者提供优质的服务。