呼吸科始建于1954年，现有专科医生19人，其中主任医师4名，副主任医师5名，博士2名，硕士7名，专科护士25人。03年扬州市首批临床重点专科，07年获批为国家药物临床验证基地。 拥有两个专科病区、呼吸重症监护室、气管镜室、肺功能室及雾化治疗室等5个组成部份，形成了以哮喘、感染、慢阻肺、胸膜腔疾病及肺部肿瘤等为主要研究方向的全方位发展的临床科室。 　　呼吸科现有耶格肺能仪、电子峰流速仪、多功能胸腹治疗仪各一台；电子、纤维气管镜三套；六台进口呼吸机，十六台多功能监护仪，十二台雾化治疗仪等多种呼吸专科设备。率先在扬州开展肺功能、纤维支气管镜、气管镜代胸腔镜、过敏原皮试、机械通气、哮喘及慢性支气管炎的雾化治疗等多项治疗技术。能熟练处理大咯血、气胸、重症哮喘及呼吸衰竭等急诊，对呼吸系统疑难、罕见的病例有深入的研究。多功能呼吸机的临床应用以及经气管镜诊断、灌洗、异物钳取和气管支架置入等技术的广泛应用，提高了呼吸科的知名度、业务水平以及重病抢救的能力。和省内外多家医院联合开展各期药物临床验证。 　　呼吸科现开设专家及专科门诊每周15人次，年门诊24000余人次，出院2500余人。近10年来，主持省市级科研课题10余项，获科技进步奖12项，新技术引进奖7项;发表学术论文180余篇。此外，承担扬州大学医学院本科及留学生班的诊断和呼吸内科的课堂教学和实习任务，接受南京医科大学等多所学校的实习生和一级、二级医院进修医师以及呼吸专科进修医师的培养任务，承担本地及邻近地区的医疗会诊，为扬州及周边地区提供了优质的医疗服务。